Учреждение Российской академии наук Дагестанский научный центр РАН был организован как Дагестанская научно-исследовательская база Академии наук СССР постановлением Совета Народных Комиссаров СССР от 30 октября 1945 г.; постановлением Президиума АН СССР от 6 октября 1949 г. База переименована в Дагестанский филиал Академии наук СССР; постановлением Президиума АН СССР от 29 января 1991 г. № 34 Дагестанский Филиал Академии наук СССР преобразован в Дагестанский научный центр Академии наук СССР. Дагестанский научный центр Российской академии наук переименован в соответствии с постановлением Президиума Российской академии наук от 18 декабря 2007 г. в Учреждение Российской академии наук Дагестанский научный центр РАН.